石英砂滤料三级处理是水的深度处理，但投入实际应用的污水处理厂并不多。它将对二级处理后的水进行脱氮除磷处理，用石英砂滤料吸附或反渗透去除水中残留的污染物，用臭氧或氯气消毒、杀灭细菌和病毒。然后将处理后的水送至中水渠道，作为冲厕所、喷洒街道、浇灌绿化带、工业用水、消防等的水源。